墨水喷码主要是应用于产品标识，和激光喷码、激光打标有很多相同的行业应用，如烟草行业、纯净水行业既有应用墨水喷码也有应用激光喷码；随着用户对标识要求的提高，墨水喷码在大部分行业已基本取代了传统的移印等落后方式。
相对来说，墨水喷码在行业应用上有以下优点：
1、基本可以在任何材料表面进行醒目标识：如各种塑料、金属、纸制品、木材等
2、对被喷印表面要求低：基本可适应任何表面包括粗糙或非平面表面的标识
3、喷头和产品距离的小范围（20mm内）变化基本不影响喷码可识别性
4、更换不同墨水可选择多种标识颜色。如红色、黄色、绿色、蓝色等
5、具有较高喷印速度（单排字符配线速度每秒2米），容易配合流水线
6、喷头小巧灵活，可以方便的从任何角度对产品喷码
因此在工业上墨水喷码应用非常广泛(见行业应用及解决方案)。
由于喷码原理限制，墨水喷码也有以下缺点：
1、标识精度有限。墨水喷码是由墨滴射出后通过高压偏转组成字符和图案，墨滴在飞行中可能受多种因素因素影响，无法进行很高精度（如计量器具等）标识。
2、分辩率有限。一般来说纵向只能达到24点，即字高最多只能由24点组成。因此整个标识的高度一般只能在12mm以内。
3、从结构上，喷码机内部除了机电系统外还有墨路系统，在长时间停用时可能使机器内部墨水干结。由于墨水由一个几十微米的喷嘴喷出，任何机器都可能出现喷嘴堵塞的故障而影响用户正常使用。（进口机器也不可避免）
4、喷码标识是半永久性标识，一般情况下喷码不会影响产品表面也不易擦除，但使用特定溶剂可以擦除。